PhD Student Position in Spatial Transcriptomics and Axonal RNA Analysis in Drosophila Brain

Inria Sophia Antipolis Sophia Antipolis, France
Français PhD / Doctoral Neurobiology 13 days left

About the position

About the research centre or Inria department L’Inria est l’Institut national de recherche en sciences du numérique, dont le centre Inria d’Université Côte d’Azur fait partie. Avec une forte expertise en informatique et mathématiques appliquées, les projets de recherche du centre Inria d’Université Côte d’Azur touchent toutes les dimensions des sciences et technologies du numérique, et génèrent de l’innovation. Implanté principalement à Sophia Antipolis, mais également à Nice ou Montpellier, il regroupe 47 équipes de recherche et neuf services d’appui. Il est présent dans les domaines de l’intelligence artificielle, la science des données, la sécurité des systèmes informatiques, la robotique, l’ingénierie de réseaux, la prévention des risques naturels, la transition écologique, la biologie numérique, les neurosciences computationnelles, les données de santé… Le Centre Inria d’Université Côte d’Azur est un acteur majeur en termes d'excellence scientifique par les résultats obtenus et les collaborations tant au niveau européen qu'international. Context Dans le cadre d’un partenariat public avec ANR. L’ objectif est de développer un algorithme de recalage et d'analyse de données de transcriptomie spatiale plus particulièrement dédié à l'analyse de population neuronale dans la drosophile. Assignment Collaboration : La personne recrutée sera en lien avec une équipe de l'institut de biologie de Valrose et une équipe de l'IPMC. Responsabilités : La personne recrutée a la charge du choix de l'algorithme, du développement du logiciel et de sa validation. Main activities Principales activés : Proposer des solutions algrotihmique pour le recalage 2D vers 3D Développer les logiciels Valider les logiciels sur les données fournies par les partenaires de l'IBV et de l'IPMC. Rédiger des articles Skills Compétences techniques et niveau requis : Niveau M2 Langage Python. Analyse d'image. Une appétance pour la biologie est appréciée Langues : anglais

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